Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL1Q9UK58 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL1Q9UK58 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms