Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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