Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
EPHA6Q9UF33 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPHA6Q9UF33 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms