Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DBF4Q9UBU7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DBF4Q9UBU7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms