Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
KLHL13Q9P2N7 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL13Q9P2N7 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms