Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP35Q9P2H5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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