Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PHRF1Q9P1Y6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PHRF1Q9P1Y6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms