Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DLL3Q9NYJ7 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms