Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GDAP2Q9NXN4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GDAP2Q9NXN4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms