Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CHCHD3Q9NX63 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CHCHD3Q9NX63 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms