Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC87Q9NVE4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC87Q9NVE4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms