Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATG3Q9NT62 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATG3Q9NT62 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms