Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TM7SF3Q9NS93 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms