Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBG7

LY9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY9Q9HBG7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LY9Q9HBG7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LY9Q9HBG7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms