Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TDRD3Q9H7E2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms