Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BCAS3Q9H6U6 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms