Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ASXL3Q9C0F0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ASXL3Q9C0F0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms