Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LRRCC1Q9C099 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LRRCC1Q9C099 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms