Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms