Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
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