Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZI7

UPF3B, Regulator of nonsense transcripts 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF3BQ9BZI7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UPF3BQ9BZI7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UPF3BQ9BZI7 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms