Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RIOK2Q9BVS4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RIOK2Q9BVS4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms