Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BPIFA3Q9BQP9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BPIFA3Q9BQP9 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms