Protein–RNA interactions for Protein: Q96S16

JMJD8, JmjC domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD8Q96S16 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
JMJD8Q96S16 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms