Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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