Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TSNARE1Q96NA8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TSNARE1Q96NA8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms