Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FGD4Q96M96 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FGD4Q96M96 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms