Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CFAP53Q96M91 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CFAP53Q96M91 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms