Protein–RNA interactions for Protein: Q96LP6

C12orf42, Uncharacterized protein C12orf42, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf42Q96LP6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
C12orf42Q96LP6 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C12orf42Q96LP6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms