Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EP400Q96L91 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms