Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BORCS6Q96GS4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BORCS6Q96GS4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms