Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SCMH1Q96GD3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms