Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX11Q96FC9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms