Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NMD3Q96D46 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NMD3Q96D46 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms