Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZNF428Q96B54 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF428Q96B54 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms