Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CARMIL3Q8ND23 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CARMIL3Q8ND23 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms