Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LTBP4Q8N2S1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LTBP4Q8N2S1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms