Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVH2

FOXP4, Forkhead box protein P4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 680 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXP4Q8IVH2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FOXP4Q8IVH2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXP4Q8IVH2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms