Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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TRAPPC6BQ86SZ2 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRAPPC6BQ86SZ2 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRAPPC6BQ86SZ2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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