Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z333

SETX, Probable helicase senataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETXQ7Z333 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SETXQ7Z333 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms