Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BHLHA9Q7RTU4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BHLHA9Q7RTU4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms