Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KNDC1Q76NI1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KNDC1Q76NI1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms