Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
HECW1Q76N89 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
HECW1Q76N89 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms