Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRINP3Q76B58 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BRINP3Q76B58 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms