Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
UBR3Q6ZT12 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
UBR3Q6ZT12 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
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