Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATRAIDQ6UW56 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms