Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CCDC174Q6PII3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC174Q6PII3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms