Protein–RNA interactions for Protein: Q685J3

MUC17, Mucin-17, humanhuman

Predictions only

Length 4,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC17Q685J3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MUC17Q685J3 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
MUC17Q685J3 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms