Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ATG16L1Q676U5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ATG16L1Q676U5 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms