Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ECM29Q5VYK3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ECM29Q5VYK3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms